Cara Menggunakan Aplikasi Kalzium

Kalzium adalah aplikasi kimia yang digunakan dalam linux yang berisi informasi tentang karakteristik dari unsur-unsur kimia dalam tabel periodik seperti nomor massa, nomor atom, energi, model atom, energy ionisasi, dan semua yang menjadi karakteristik dari suatu unsur tersebut.

Tampilannya :

Bagaimana cara membuatnya?mudah saja… :)

Kalzium dapat menampilakn berbagai bentuk dari Periodic Table, caranya tinggal memilih icon yang berisikan pilihan Classic, Short, Long, Transition, atau juga DZ Periodik Table. 

Disini saya memilih tampilan Long Periodic Table, selain itu kita juga bisa menggunakan fitur Scheme untuk memilih tampilan dari periodic table, seperti pilihan Icon yang disertai dengan gambar contoh dalam kehidupan.

Selain itu kita juga dapat memilih fitur Gradient yang dapat menampilkan gradiasi warna dari Periodic Table tersebut.

Bagi anda yang ingin mengetahui melting point, boiling point, dll dapat melihatnya dengan mengklik salah satu unsur yang dikehendaki. Disini saya mencoba untuk melihat karakteristik dari unsur Li :

Untuk melihat model atomnya dengan cara klik atom model, seperti berikut :

Kita bisa melihat unsur-unsur lain hanya dengan cara klik icon pilihan Previous :

Jika anda mengetahui manfaat lebih dari aplikasi kimia ini kita bisa memilih fitur tool Plot Data. Untuk menuju tool Plot Data, klik menu Tool dan  pilih Plot Data. Pada tool  ini dapat dilakukan pem-plot-an antara sumbu X dan Y (dalam sebuah grafik) beberapa sifat periodik unsur untuk melihat kecenderungan suatu unsur.

Bagian sumbu X dan Y terdapat nomor atom (Atomic Number), massa atom (Mass), elektronegatifitas (Electronegativity), titik lebur (Melting Point), titik didih (Boiling Point), jari-jari atom (Atomic Radius), dan jari-jari kovalen (Covalent Radius).

Sebelum melakukan pem-plot-an tentukan terlebih dahulu First element dan Last element dengan mengetikan angka atau menekan tanda panah atas-bawah. Atur juga bagian Display (Tampilan), apakah kita ingin menampilkan label (nama unsur atau simbol unsur) pada titik-titik plot atau dibiarkan kosong tanpa label.

Pokok bahasan yang bisa memanfaatkan Plot Data ini antara lain:

• Sistem periodik unsur (sifat periodik unsur). Di sini kita bisa mempelajari tentang berbagai kecenderungan unsur dengan naiknya nomor atom, atau dalam jenis unsur tertentu (logam-non logam, masing-masing blok, golongan)
• Ikatan kimia (ikatan ion, ikatan kovalen, ikatan logam). Bahasan ikatan kimia bisa memanfaatkan data elektronegativitas untuk menentukan kemungkinan suatu unsur membentuk ikatan dengan unsur lainnya. Apakah mereka akan membentuk ikatan ion, ikatan kovalen, atau ikatan logam.
• Kimia unsur (kelimpahan unsur). Beberapa karakteristik unsur juga bisa dipelajari dengan menggunakan plot data Kalzium ini.
• Pokok bahasan lain yang memerlukan plot data unsur-unsur.

Read More

Cara Menggunakan Aplikasi Qute Mol

Pada pembahasan kali ini, saya akan membahas tentang aplikasi kimia yang dapat dijalankan pada sistem operasi berbasis linux ini, salah satunya adalah aplikasi qutemol.

Qutemol merupakan salahsatu aplikasi kimia yang cukup menarik untuk dipelajari di linux. Aplikasi ini merupakan aplikasi gratis dan open source yang yang cukup menarik dan interaktif dalam menampilkan sistem visualisasi molekular.

Aplikasi  ini menawarkan berbagai efek visual yang inovatif sesuai dengan keinginan serta pilihan dimana teknik visualisasi ini ditujukan untuk meningkatkan kejelasan serta pemahaman pada pengamatan struktur molekul secara luas  sehingga kita akan lebih mudah dalam memahami visual molekul yang akan diamati dalam bentuk 3D dengan bantuan aplikasi ini.

1.    Dalam melakukan pengamatan visual pada aplikasi ini terlebih dulu kita harus mencari file .pdb dan .vdb dari molekul yang akan kita amati. Hal ini  dikarena aplikasi qutemol hanya dapat bekerja dengan dua jenis ekstensi file ini (.pdb dan .vdb). sementara langkah-langkah pengguanaan aplikasi ini adalah sebagai berikut :1. Buka aplikasi Qutemol. Pada tampilan awal, aplikasi ini akan memberikan tampilan seperti pada gambar berikut:

2.      Klik ikon browse seperti pada gambar dibawah ini untuk memasukkan file dengan format .pdb yang merupakan file molekul yang akan diamati.

3.      Pilih file yang akan diamati lalu klik OK. Sebagai contoh pada pembahasan kali ini saya akan mengguna kan file H2O.pdb

4.      Untuk melakukan pengamatan, bentuk molekul dapat dipilih dan disesuaikan dengan keinginan untuk memperoleh visual yang benar-benar jelas untuk diamati yakni dengan memilih beberapa opsi pada menu bagian kanan dari jendela aplikasi qutemol.

5.      Pada tab preset kita dapat mengatur bentuk molekul yang kita amati sesuai dengan keinginan untuk memperoleh visual yang benar-benar jelas untuk diamati. caranya adalah dengan memilik (klik) menu-menu yang ada pada tab preset, maka bentuk molekul akan berubah-ubah sesuai dengan pilihan. Berikut adalah beberapa contohnya yakni pada pilihan ‘Molecule of the Month‘, ‘Direct Light Only’, dan ‘Simulated S.E.M. 1′ .

                                              

6.      Selanjutnya pada tab Geometry kita akan menemukan beberapa menu untuk merubah tampilan molekul dengan pilihan ‘Space Fill’,’Licorice’, dan ‘Balls’n’Sticks’.

                 

7.      Pada tab customize kita dapat menyesuaikan bentuk molekiul yang akan diamati dengan lebih spesifik dimana pada tab ini kita dapat mengatur warna molekul, background, saturasi, kecerahan, ketajaman dan pilihan lainnya.

8.      Selanjutnya, selain berfungsi sebagai aplikasi visualisasi, aplikasi ini juga dapat untuk mencapture gambar molekul yang diamati, yakni dengan cara klik ikon capture sepererti pada gambar dibawah ini.

9.      Pilih lokasi penyimpanan lalu tunggu dan molekul yang kita amati akan tersimpan dalam bentuk file gambar .png

Semoga bermanfaat, selamat mencoba!

Read More

TUTORIAL APLIKASI GAMGI

 

 Cara Menggunakan Aplikasi Gamgi

 

GAMGI adalah sebuah perangkat lunak open source untuk penciptaan dan analisis struktur atom. GAMGI (General Atomistic Modelling Graphic Interface) adalah sebuah program untuk membangun, melihat, dan menganalisis strucures atom seperti molekul, kristal, gelas, cairan, dll Ini bertujuan untukmenjadi berguna untuk: masyarakat ilmiah bekerja di Pemodelan atomistik yang membutuhkan grafis antarmuka untuk membangun input data dan untuk melihat dan menganalisis data output, dihitung dengan Ab initio-dan Molekuler Mekanika program, komunitas ilmiah di bidang kimia belajar yang besar, fisika, ilmu material, geologi, dll, yang membutuhkan antarmuka grafis untuk melihat dan menganalisis atom struktur informasi dan untuk mempersiapkan gambar untuk presentasi di kelas dan seminar, mengajar kimia dan fisika di sekolah menengah dan perguruan tinggi, ilmu promosi di sekolah-sekolah, pameran dan museum ilmu pengetahuan.

Cara menggunakan GAMGI adalah sebagai berikut.

Buka aplikasi menu gamgi  maka akan terlihat tampilan di bawah  ini:

Jangan khawatir tidak bisa menggunakan apliksai Gamgi, karena di dalam aplikasi ada menu tutorialnya. Untuk memunculkan menu tutorial adalah Klik Help-Tutorial, maka akan muncul

Nah saya mencoba untuk membuat bentuk kristal NaCl. Tutorial yang tampak adalah:

Dengan Tutorial tersebut sedikit membantu kita dalam pembuatan struktur NaCl.

Untuk membuat cell maka kita harus klik cell-create-. Maka akan muncul tampilan seperti di bawah ini. Isi sesuai dengan tutorial   

Sedangkan untuk tampilan “atom-create” muncul tampilan seperti dibawah ini. Untuk mengisi data-data tersebut. Anda harus klik table:

Setelah saat Anda Klik Table maka muncul tampilan seperti di bawah ini. Pilih atom Na

 Tampilan yang akan muncul adalah seperti di bawah ini

Terima kasih dan selamat mencoba :)

Read More

TUTORIAL APLIKASI EASYCHEM

 

Cara Menggunakan Aplikasi Easychem

Easychem chemical structure editor adalah aplikasi untuk menggambar struktur 2D ikatan kimia. Instalasi bisa langsung lewat Ubuntu Software Center. Aplikasi ini sangat mudah digunakan, disediakan fungsi Help untuk format penulisan senyawa-senyawa kimia dari yang sederhana hingga yang kompleks. Dari ikatan tunggal, ikatan rangkap, hingga ikatan siklo bisa digambar dengan mudah menggunakan aplikasi ini.

Bagi para ilmuwan, atau pekerja laboratorium, mahasiswa, pelajar, ataupun pengajar sains saya sarankan menggunakan aplikasi ini. Bisa diekspor dalam format PDF, sehingga bisa disalin di dokumen yang lain.

Terima kasih dan selamat mencoba :)

Read More

Cara Menggunakan Aplikasi Chemdraw

 

Chemdraw merupakan software kimia dari produk Cabridgesoft.inc. ChemDraw memiliki banyak fungsi, diantaranya membuat nama dan struktur senyawa,. membuat struktur streokimia dengan benar dari nama kimia, dan mendapatkan nama IUPAC dengan akurat dari struktur. Perkiraan spektra NMR dari struktur suatu senyawa dengan atom langsung dengan korelasi spektral. Selain itu, ChemDraw dilengkapi dengan peringatan jika terjadi kesalahan dalam pembuatan struktur kimia. Peringatan tersebut biasanya berwarna merah dan mengelilingi bagian struktur yang salah.

Setelah berhasil melakukan installasi ChemDraw 11 maka pada PC akan terlihat program baru yang bernama ChemBioOffice 2008 yang di dalamnya terdapat ChemDraw Ultra 11.0. Klik ChemDraw Ultra 11 maka akan tampil gambar sebagai berikut:

Misalnya ingin mengetahui nama struktur senyawa CH₃CHOHCH₂CH₃
Langkah-langkahnya adalah sebagai berikut :

1.      Buat struktur senyawa CH₃CHOHCH₂CH₃ pada lembar ChemDraw

2.      Pilih structure pada bagian toolbar

3.      Pilih structure convert to name

4.      Setelah itu nama dari senyawa CH₃CHOHCH₂CH₃ akan muncul seperti gambar dibawah ini.

Sebaliknya ChemDraw juga dapat menggambarkan struktur suatu senyawa dari nama senyawa tersebut. Langkah-langkahnya adalah sebagai berikut :

1.      Tulis nama suatu senyawa pada lembar ChemDraw

2.      Pilih structure pada bagian toolbar

3.      Pilih name convert to structure sesuai (IUPAC)

Download Software copy paste link berikut:

http://www.4shared.com/file/fdQKL-nO/ChemDraw11part3.htm

Read More

Cara Menggunakan Aplikasi Chemix

Fitur yang disediakan antara lain

• Ø Tabel sistem periodik beserta keterangan detail tiap unsur.
• Ø Bisa menentukan senyawa berdasarkan spektroskopi senyawa tersebut.
• Ø Kamus khusus kimia
• kalkulator
• unit konversi panjang, berat, tekanan, daya, temperatur, dsb.
• Ø Menghitung persamaan gas gay lussac.
• Ø Menampilkan 3d dari molekul.
• Ø Menghitung dan menggambar kurva persamaan diagram fasa 3 maupun 2 fasa / lebih. Cocok untuk mata kuliah kimia fisika.
• Ø Menghitung persamaan kurva serta menggambar kurvanya.
• Ø Menghitung asam basa serta pkw, pka, ph, poh dan pkb.
• Ø Menampilkan kelarutan tiap senyawa/ solubility chart.
• Ø Menghitung kelarutan.
• Ø Elektrokimia.
• Ø Kalkulator molekul
• Ø Termokimia.
• Ø Menghitung stoikiometri senyawa.

Screenshotnya

Tutorial penggunaan chemix adalah sebagai berikut :

Menambahkan & Menyeret

Untuk menambahkan aparat, pilih item dari toolbar atas . Untuk mengubah kategori, klik pada tombol berlabel kecil di setiap sisi toolbar. Saat ini, ada 5 kategori dengan 8 item per setiap. Setelah menambahkan item, muncul di ruang kerja. Untuk tarik ke tempat yang tepat, cukup klik dengan mouse kiri, drag dan kemudian lepaskan. Anda hanya dapat menarik satu item pada suatu waktu, multiselection tidak didukung.

Menggunakan Editor

Untuk memutar atau mengubah gaya item, tarik ke alun-alun berlabel ’sensor’ sampai lampu merah pergi hijau. Tekan panah untuk memutar item, tekan tombol bintang untuk mengubah gaya. Tidak semua item mendukung perubahan gaya.

Menghapus

Untuk menghapus item, menyeret mereka sampah. Untuk menghapus beberapa item, Anda dapat menarik bin (dengan mengklik bar bagian atas di atas tempat sampah) atas barang-barang Anda. Setiap barang yang bersimpangan dengan sampah, akan dihapus.

Memunculkan tabel

Untuk menghentikan pengaturan aparat dari ’melayang’ di udara, klik tombol kiri bawah untuk menampilkan tabel. Klik lagi untuk menyembunyikannya.

Finishing

Sayangnya Chemix tidak memungkinkan Anda untuk menyimpan atau mengekspor pekerjaan Anda menjadi sebuah gambar, namun Anda hanya dapat mengambil screenshot, menghapus semua toolbar dan item UI dalam program cat dan kemudian paste gambar yang dihasilkan di tempat yang diinginkan. Chemix memiliki banyak sekali fitur.

Dalam mata pelajaran ikatan kimia chemix banyak memberi kemudahan antara lain untuk mengetahui jari-jari kovalen suatu senyawa, untuk mengetahui besarnya keelektronegatifan suatu unsur sehingga memudahkan untuk mengetahui kepolaran suatu senyawa kovalen berdasarkan perbedaan harga keelektonegatifannya. Serta berguna juga untuk mengetahui struktur kristal atom.

Periodic Table

Periodic table - graphics

Periodic table - properties

Terima kasih dan selamat mencoba :)

Read More