Download Silabus KIMIA SMA

Download silabus Kimia SMA disini

Read More

TUTORIAL APLIKASI PYMOL

  Cara  Mengguanakan Aplikasi Pymol

PyMOL is a molecular graphics system with an embedded Python interpreter designed for real-time visualization and rapid generation of high-quality molecular graphics images and animations. It can also perform many other valuable tasks (such as editing PDB files) to assist you in your research.

       Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah mengetahui bentuk molekul, Van der Walls radius, hingga mesh yang dimiliki  oleh suatu molekul.

Berikut cara mudahnya :

Pertama kita harus membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.

Klik toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita pilih fitur Residue → Alanine.

kemudian apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa pilih fitur L-toolbar → other properties →formal charge

jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar → vdw radius

untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar → element symbol

pilih S-toolbar → dots

dan kemudian jika ingin mengetahui mesh dan surface pilih S-toolbar→ mesh dan S-toolbar → surface

 

Get view dan kemudian Orient

Selamat Mencoba dan Terima Kasih :)

Read More

TUTORIAL APLIKASI GDPC

Cara Aplikasi GDPC

 
gdpc adalah program untuk memvisualisasikan simulasi dinamika molekul, ini adalah program yang sangat fleksibel dan dapat dengan mudah digunakan untuk tujuan lain. gdpc membaca xyz masukan dan adat format dan dapat menulis gambar dari frame.
Changelog:

• 2.2.5: Kecil kode pembersihan
• Simbol usang diperbarui dalam GTK + 2.16.
• Diperbarui Makefile dan file spesifikasi, disumbangkan oleh Jussi Lehtola.
• 2.2.4: peningkatan fitur kecil
• Resize jendela utama juga mengubah ukuran viewport.
• 2.2.3.1: peningkatan fitur kecil
• Parameter yang benar untuk mendapatkan rotasi mulus dan diminimalkan penundaan antara frame.
• 2.2.3: peningkatan fitur kecil
• Meningkatkan interaktivitas selama animasi (itu harus benar sekarang, sekali dan untuk semua).
• Ditambahkan sekali dan parameter commandline memutar (disumbangkan oleh Santeri Paavolainen).
• Kebocoran memori dan misc lainnya. bug tetap (termasuk kontribusi oleh Santeri Paavolainen).
• 2.2.2: peningkatan fitur kecil
• Meningkatkan interaktivitas selama animasi.
• 2.2.1: Bug perbaikan
• Membuat rotasi berperilaku baik. Hal ini telah rusak sejak pertama kali diperkenalkan.
• Hapus beberapa printfs debuging kelebihan.
• Memperbaiki kecil dari Makefile untuk meningkatkan generasi rpm.
• 2.2.0: Porting ke gtk + 2.2
• G3data porting ke gtk + 2.2.
• Semua fungsi usang dihapus.
• Ditambahkan kemungkinan untuk menekan tombol ruang untuk 'bsleep' pilihan.
• 2.1.2: Ditambahkan fungsi
• Ditambahkan 'bsleep' parameter yang memungkinkan pengguna untuk mengubah frame dengan menekan mousebutton tengah.
• Dihapus editability dari entri teks.
• 2.1.1: Sentuhan akhir pada port untuk gtk + 2.0
• Semua fungsi usang yang tersisa dari gtk + 1.x telah diganti dengan fungsi baru gtk + 2.0.
• Gtk resmi + 2.0 rilis stabil.
• 2.00 Mayor rilis stabil: perbaikan bug minor
• Tetap beberapa bug minor berputar
• 2.00pre2 (pembangunan): Perbaikan bug
• Tetap semaphore inisialisasi bug. Thread bisa meninggalkan menunggu semaphore yang tidak pernah berubah.
• Tetap potensi buffer overflow bug serius dan beberapa.
• Tetap beberapa bug minor.

Download:
Terbaru gtk + 2.16 compliant versi:

• gdpc 2.2.5 Sumber (2448 KB)
• gdpc 2.2.5 x86_64 RPM dibangun di Fedora 11 (2429 KB)
• gdpc 2.2.5 Sumber RPM (2353 KB)

Masalah yang diketahui:

• Tak satupun

Screenshot:

Jendela Setup untuk gdpc, jendela ini secara otomatis muncul jika tidak ada parameter commandline dilewatkan ke program.

Aksi. Inilah yang gdpc tampak seperti ketika menghidupkan simulasi dinamika molekul. Animasi khusus ini adalah bagian cair dari Silicon setelah satu atom Si diberi energi kinetik dari 1 keV. Terimakasih, semoga bermanfaat :-)

Read More